Short tandem repeat

Short tandem repeats (STR’s) of short tandem repeat polymorphisms (STRP's) (Engels: korte herhalingen achter elkaar) zijn vaak 2, 3 of 4 nucleotiden lang ( di, tri en tetranucleotiden repeats ) en worden gemiddeld 10 tot 100 keer herhaald. Ze komen voor in de intronen of in het junk-DNA. De STR’s worden dus niet vertaald naar eiwitten, maar horen wel aanwezig te zijn voor het functioneren van een gen.

Een deel van een menselijk STR profiel verkregen met Applied Biosystems Identifiler kit.

Als STR’s te lang of te kort zijn kan dit een ziekte of aandoening ten gevolgen hebben doordat de functie van het gen dat in de buurt ligt verstoord wordt. De eerst gevonden en meest voorkomende repeat is: CA CA CA. Deze komt om de paar duizend basenparen voor.

STR’s zijn zeer polymorf en het aantal repeats in een bepaalde STR verschilt van persoon tot persoon. Dit komt doordat er gemakkelijk een repeat bij gemaakt kan worden (insertie) of dat er een verwijderd wordt (deletie). STR’s worden dan ook gebruikt bij vaderschapstests en bij de identificatie van personen, omdat iedereen een uniek profiel heeft van de lengte van verschillende STR’s. Er komen verschillende soorten STR’s voor van simpel CA CA CA tot zeer complex GTACATG GTACATG GTACATG.