Aspergillus luchuensis

Aspergillus luchuensis
Scientific classification
Kingdom:Fungi
Division:Ascomycota
Class:Eurotiomycetes
Order:Eurotiales
Family:Trichocomaceae
Genus:Aspergillus
Species: A. luchuensis
Binomial name
Aspergillus luchuensis
(1901)[1]
Synonyms

Aspergillus foetidus and Aspergillus acidus

Aspergillus luchuensis (previous names A. foetidus and A. acidus) is a species of fungus in the genus Aspergillus. A. luchuensis belongs to the group of black Aspergilli which are important industrial workhorses.[2][3][4] A. luchuensis belongs to the Nigri section. It has been used to produce awamori, which is a distilled alcoholic beverage made on the Okinawa islands in Japan[5]. The species was first described in 1901 Japan.[1] Its genome has been sequenced in by two different research groups first in 2016[6] and then in 2017[7][8]. The first sequencing of the A. luchuensis genome reported a genome assembly size of 34.7 Mbp and reported the presence of 11,691 genes.

References

  1. 1 2 Inui, T.: Ryukyu awamori hakko kin chyosa houkokusyo, J. Chem. Soc. Japan, 4, 1421–1430 (1901)
  2. Pel, H. J.; de Winde, J. H.; Archer, D. B.; Dyer, P. S.; Hofmann, G.; Schaap, P. J.; Turner, G.; de Vries, R. P.; Albang, R.; Albermann, K.; Andersen, M. R.; Bendtsen, J. D.; Benen, J. A. E.; van den Berg, M.; Breestraat, S.; Caddick, M. X.; Contreras, R.; Cornell, M.; Coutinho, P. M.; Danchin, E. G. J.; Debets, A. J. M.; Dekker, P.; van Dijck, P. W. M.; van Dijk, A.; Dijkhuizen, L.; Driessen, A. J. M.; d’Enfert, C.; Geysens, S.; Goosen, C.; Groot, G. S. P.; de Groot, P. W. J.; Guillemette, T.; Henrissat, B.; Herweijer, M.; van den Hombergh, J. P. T. W.; van den Hondel, C. A. M. J. J.; van der Heijden, R. T. J. M.; van der Kaaij, R. M.; Klis, F. M.; Kools, H. J.; Kubicek, C. P.; van Kuyk, P. A.; Lauber, J.; Lu, X.; van der Maarel, M. J. E. C.; Meulenberg, R.; Menke, H.; Mortimer, M. A.; Nielsen, J.; Oliver, S. G.; Olsthoorn, M.; Pal, K.; van Peij, N. N. M. E.; Ram, A. F. J.; Rinas, U.; Roubos, J. A.; Sagt, C. M. J.; Schmoll, M.; Sun, J.; Ussery, D.; Varga, J.; Vervecken, W.; van de Vondervoort, P. J. J.; Wedler, H.; Wösten, H. A. B.; Zeng, A.-P.; van Ooyen, A. J. J.; Visser, J.; Stam, H. Genome sequencing and analysis of the versatile cell factory Aspergillus niger CBS 513.88. Nat. Biotechnol. 2007, 25, 221–231, doi:10.1038/nbt1282.
  3. 1. Pel, H. J.; de Winde, J. H.; Archer, D. B.; Dyer, P. S.; Hofmann, G.; Schaap, P. J.; Turner, G.; de Vries, R. P.; Albang, R.; Albermann, K.; Andersen, M. R.; Bendtsen, J. D.; Benen, J. A. E.; van den Berg, M.; Breestraat, S.; Caddick, M. X.; Contreras, R.; Cornell, M.; Coutinho, P. M.; Danchin, E. G. J.; Debets, A. J. M.; Dekker, P.; van Dijck, P. W. M.; van Dijk, A.; Dijkhuizen, L.; Driessen, A. J. M.; d’Enfert, C.; Geysens, S.; Goosen, C.; Groot, G. S. P.; de Groot, P. W. J.; Guillemette, T.; Henrissat, B.; Herweijer, M.; van den Hombergh, J. P. T. W.; van den Hondel, C. A. M. J. J.; van der Heijden, R. T. J. M.; van der Kaaij, R. M.; Klis, F. M.; Kools, H. J.; Kubicek, C. P.; van Kuyk, P. A.; Lauber, J.; Lu, X.; van der Maarel, M. J. E. C.; Meulenberg, R.; Menke, H.; Mortimer, M. A.; Nielsen, J.; Oliver, S. G.; Olsthoorn, M.; Pal, K.; van Peij, N. N. M. E.; Ram, A. F. J.; Rinas, U.; Roubos, J. A.; Sagt, C. M. J.; Schmoll, M.; Sun, J.; Ussery, D.; Varga, J.; Vervecken, W.; van de Vondervoort, P. J. J.; Wedler, H.; Wösten, H. A. B.; Zeng, A.-P.; van Ooyen, A. J. J.; Visser, J.; Stam, H. Genome sequencing and analysis of the versatile cell factory Aspergillus niger CBS 513.88. Nat. Biotechnol. 2007, 25, 221–231, doi:10.1038/nbt1282. 2. Goldberg, I.; Rokem, J. S.; Pines, O. Organic acids: old metabolites, new themes. Journal of Chemical Technology & Biotechnology 2006, 81, 1601–1611, doi:10.1002/jctb.1590.
  4. Pariza, M. W.; Foster, E. M. Determining the Safety of Enzymes Used in Food Processing. Journal of Food Protection 1983, 46, 453–468, doi:10.4315/0362-028X-46.5.453.
  5. Yamada, O.; Takara, R.; Hamada, R.; Hayashi, R.; Tsukahara, M.; Mikami, S. Molecular biological researches of Kuro-Koji molds, their classification and safety. J. Biosci. Bioeng. 2011, 112, 233–237, doi:10.1016/j.jbiosc.2011.05.005.
  6. Yamada, O.; Machida, M.; Hosoyama, A.; Goto, M.; Takahashi, T.; Futagami, T.; Yamagata, Y.; Takeuchi, M.; Kobayashi, T.; Koike, H.; Abe, K.; Asai, K.; Arita, M.; Fujita, N.; Fukuda, K.; Higa, K.; Horikawa, H.; Ishikawa, T.; Jinno, K.; Kato, Y.; Kirimura, K.; Mizutani, O.; Nakasone, K.; Sano, M.; Shiraishi, Y.; Tsukahara, M.; Gomi, K. Genome sequence of Aspergillus luchuensis NBRC 4314. DNA Res 2016, 23, 507–515, doi:10.1093/dnares/dsw032.
  7. de Vries, R. P.; Riley, R.; Wiebenga, A.; Aguilar-Osorio, G.; Amillis, S.; Uchima, C. A.; Anderluh, G.; Asadollahi, M.; Askin, M.; Barry, K.; Battaglia, E.; Bayram, Ö.; Benocci, T.; Braus-Stromeyer, S. A.; Caldana, C.; Cánovas, D.; Cerqueira, G. C.; Chen, F.; Chen, W.; Choi, C.; Clum, A.; dos Santos, R. A. C.; Damásio, A. R. de L.; Diallinas, G.; Emri, T.; Fekete, E.; Flipphi, M.; Freyberg, S.; Gallo, A.; Gournas, C.; Habgood, R.; Hainaut, M.; Harispe, M. L.; Henrissat, B.; Hildén, K. S.; Hope, R.; Hossain, A.; Karabika, E.; Karaffa, L.; Karányi, Z.; Kraševec, N.; Kuo, A.; Kusch, H.; LaButti, K.; Lagendijk, E. L.; Lapidus, A.; Levasseur, A.; Lindquist, E.; Lipzen, A.; Logrieco, A. F.; MacCabe, A.; Mäkelä, M. R.; Malavazi, I.; Melin, P.; Meyer, V.; Mielnichuk, N.; Miskei, M.; Molnár, Á. P.; Mulé, G.; Ngan, C. Y.; Orejas, M.; Orosz, E.; Ouedraogo, J. P.; Overkamp, K. M.; Park, H.-S.; Perrone, G.; Piumi, F.; Punt, P. J.; Ram, A. F. J.; Ramón, A.; Rauscher, S.; Record, E.; Riaño-Pachón, D. M.; Robert, V.; Röhrig, J.; Ruller, R.; Salamov, A.; Salih, N. S.; Samson, R. A.; Sándor, E.; Sanguinetti, M.; Schütze, T.; Sepčić, K.; Shelest, E.; Sherlock, G.; Sophianopoulou, V.; Squina, F. M.; Sun, H.; Susca, A.; Todd, R. B.; Tsang, A.; Unkles, S. E.; van de Wiele, N.; van Rossen-Uffink, D.; Oliveira, J. V. de C.; Vesth, T. C.; Visser, J.; Yu, J.-H.; Zhou, M.; Andersen, M. R.; Archer, D. B.; Baker, S. E.; Benoit, I.; Brakhage, A. A.; Braus, G. H.; Fischer, R.; Frisvad, J. C.; Goldman, G. H.; Houbraken, J.; Oakley, B.; Pócsi, I.; Scazzocchio, C.; Seiboth, B.; vanKuyk, P. A.; Wortman, J.; Dyer, P. S.; Grigoriev, I. V. Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus. Genome Biology 2017, 18, 28, doi:10.1186/s13059-017-1151-0.
  8. https://genome.jgi.doe.gov/Aspfo1/Aspfo1.home.html


This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.